Terapeutyczna metoda opracowana przez ks. Sebastiana Kneippa oparta jest na pięciu filarach:
- hydro- i balneoterapii
- terapii ruchowej
- terapii żywieniowej
- terapii zielnej
- terapii porządkującej

Hydro- i balneoterapia stanowi wysoce rozwiniętą formę wodolecznictwa, ukierunkowaną na indywidualne potrzeby Kuracjusza. Woda, w formie cieczy lub w formie pary, kiedy bywa właściwie wykorzystywana, dzięki swym naturalnym właściwościom termicznym, chemicznym, mechanicznym i hydroelektrycznym, stymuluje organizm do takich reakcji, które w konsekwencji prowadzą do pozytywnej regulacji wszystkich jego funkcji.

Aktywna i pasywna terapia ruchowa przyczynia się do poprawienia ogólnej kondycji organizmu i przynosi dobre samopoczucie. Poleca się: gimnastykę ogólną i leczniczą, Nordic Walking [chód-marsz], wędrowanie, jazdę rowerową, pływanie, gimnastykę wodną oraz różnorodne formy masażu.

Wyważona i wielostronna terapia żywieniowa uwzględnia pełnowartościowe, pełnoziarniste produkty naturalne (eko-produkty), witaminy, sole mineralne, fermenty i pierwiastki naturalne. W trakcie trwania terapii powinno się w znacznym stopniu zrezygnować z denaturalizowanych środków żywności i z używek.

Terapia zielna oparta jest na wykorzystaniu krytycznie przetestowanych, naturalnych środków leczniczych, sporządzonych na bazie ziół.

Terapia porządkująca uwzględnia psychosomatyczne, ekologiczne i socjologiczne uwarunkowania człowieka. Opiera się ona na ważnej maksymie ks. Sebastiana Kneippa: "W zachowaniu umiaru leży przyczyna porządku. Każde za dużo, jak i za mało, powoduje zamiast zdrowia, chorobę". Zwykł on także mawiać:

"Pozytywne skutki mojego sposobu leczenia zacząłem odczuwać dopiero wtedy, kiedy udało mi się zapewnić porządek w duszach moich pacjentów".